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北大在蛋白酶體全原子動力學(xué)分析取得突破

   日期:2018-11-19     瀏覽:101    
核心提示:發(fā)布日期:2018-11-19   11月12日,北京大學(xué)物理學(xué)院人工微結(jié)構(gòu)和介觀物理國家重點(diǎn)實(shí)

發(fā)布日期:2018-11-19

  11月12日,北京大學(xué)物理學(xué)院人工微結(jié)構(gòu)和介觀物理國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、前沿交叉學(xué)院定量生物學(xué)中心毛有東課題組在《自然》(Nature)雜志在線發(fā)表了題為Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome(《底物結(jié)合的人源26S蛋白酶體的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)和動力學(xué)》)的研究論文。據(jù)介紹,這是《自然》上發(fā)表的系統(tǒng)性的、優(yōu)于3.6埃分辨率水平實(shí)驗(yàn)研究超大復(fù)合蛋白質(zhì)機(jī)器的動力學(xué)過程和原理的第一篇論文,標(biāo)志著冷凍電鏡的發(fā)展終于開始進(jìn)入期待已久的全原子動力學(xué)分析的新時(shí)代,被審稿人譽(yù)為相關(guān)領(lǐng)域的“里程碑”。

  據(jù)悉,由于《自然》編輯部和審稿人對該論文發(fā)表極其重視,該論文從今年9月11日投稿、審稿到11月12日正式Online,僅用兩個(gè)月時(shí)間,以加速出版的形式在線發(fā)表。

  泛素-蛋白酶體體系(Ubiquitin-Proteasome System,簡稱UPS)是細(xì)胞內(nèi)最重要的蛋白質(zhì)降解通路,對維持生物體內(nèi)蛋白質(zhì)的濃度平衡,以及對調(diào)控蛋白、錯(cuò)誤折疊或受到損傷的蛋白的快速降解起著至關(guān)重要的作用,參與了細(xì)胞周期、基因表達(dá)調(diào)控等多種細(xì)胞進(jìn)程,由UPS失常引發(fā)的蛋白質(zhì)新陳代謝異常與眾多人類重大疾病直接相關(guān)。

  盡管上述工作揭示了蛋白酶體的基本架構(gòu)和內(nèi)在運(yùn)動行為,但由于缺乏蛋白酶體與底物之間的相互作用,人們對于蛋白酶體如何實(shí)現(xiàn)底物降解的原子水平工作機(jī)制仍一無所知。此外,盡管冷凍電鏡技術(shù)近年來廣泛應(yīng)用于分析具有動態(tài)特征的蛋白復(fù)合體結(jié)構(gòu)和平衡態(tài)構(gòu)象,但對其中間態(tài)結(jié)構(gòu)和非平衡構(gòu)象分析的分辨率水平往往局限在4~6?;蚋?,離真正的全原子水平動力學(xué)分析還有相當(dāng)一段距離。

  而該論文通過冷凍電子顯微鏡和機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)的結(jié)合,解析了人源蛋白酶體26S在降解底物過程中的7種中間態(tài)構(gòu)象的高分辨(2.8~3.6埃)精細(xì)原子結(jié)構(gòu),最好局部分辨率達(dá)2.5埃。

  據(jù)北京大學(xué)介紹,這些研究結(jié)果為幾十年來對蛋白酶體功能的研究提供了寶貴的第一手原子結(jié)構(gòu)和動力學(xué)信息,對于理解生物體內(nèi)蛋白質(zhì)的降解過程和一系列負(fù)責(zé)物質(zhì)輸運(yùn)的ATPase馬達(dá)分子的一般工作原理具有極為重要的科學(xué)意義,也標(biāo)志著北大冷凍電鏡平臺的建設(shè)后來居上,在數(shù)據(jù)采集效率和成像分辨率等各方面已達(dá)到國際領(lǐng)先水平。(記者 葉雨婷)

來源:中國青年報(bào)

 
 
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