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電子芯片奮力“轉(zhuǎn)正”,生物芯片能否自力更生?

   日期:2019-05-22     瀏覽:232    
核心提示:發(fā)布日期:2019-05-22   前言:   去年,中興被美國(guó)開(kāi)罰單禁止購(gòu)買(mǎi)核心零件的教訓(xùn)仍

發(fā)布日期:2019-05-22

  前言:

  去年,中興被美國(guó)開(kāi)罰單禁止購(gòu)買(mǎi)核心零件的教訓(xùn)仍然歷歷在目;近日,華為備胎“芯片”轉(zhuǎn)正的新聞?dòng)炙⒈伺笥讶?。芯片之殤讓?guó)人痛定思痛,一定要掌握核心科技,自力更生。談起電子芯片讓人難免聯(lián)想到體外診斷IVD領(lǐng)域的“生物芯片”技術(shù)。我國(guó)的生物芯片行業(yè)在1997-1998年開(kāi)始蓬勃發(fā)展,盡管目前的市場(chǎng)份額和核心技術(shù)仍主要由外資企業(yè)壟斷,但國(guó)內(nèi)已經(jīng)有多家公司開(kāi)始奮力追趕。

  一、生物芯片是生物材料的集成

  生物芯片借鑒計(jì)算機(jī)平行分析的思想,對(duì)海量的生物信號(hào)進(jìn)行平行分析。被動(dòng)式生物芯片,又稱微陣列芯片,通過(guò)微加工技術(shù)和微電子技術(shù),將成千上萬(wàn)個(gè)生物信息密碼集中到一小片固相基質(zhì)上,以實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞、蛋白質(zhì)、DNA以及其他生物組分的準(zhǔn)確、快速、高通量的檢測(cè)。主動(dòng)式生物芯片把生物實(shí)驗(yàn)中的樣本處理純化、反應(yīng)標(biāo)記及檢測(cè)等多個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟集成,通過(guò)一步反應(yīng)就可主動(dòng)完成。 其特點(diǎn)是快速、操作簡(jiǎn)單,因此有人又將它稱為功能生物芯片 。主要包括微流控芯片(microfluidic chip)和芯片實(shí)驗(yàn)室(lab on chip)。專家預(yù)測(cè)芯片實(shí)驗(yàn)室會(huì)是生物芯片的主流發(fā)展方向。這些年來(lái),片上系統(tǒng)的相關(guān)技術(shù)已經(jīng)逐漸成熟。今后幾年,多款芯片實(shí)驗(yàn)室產(chǎn)品將會(huì)上市。

  生物芯片的基質(zhì)材料有尼龍膜、玻璃片、塑料、硅膠晶片、微型磁珠等;而根據(jù)所檢測(cè)的生物信號(hào)分類,分為核酸芯片、蛋白質(zhì)芯片、細(xì)胞芯片甚至組織碎片芯片等;按工作原理分,有雜交型、合成型、連接型、親和識(shí)別型等。

  生物芯片有高通量性(可同時(shí)分析成千上萬(wàn)種分子)、微型化(所需試劑用量小)、高度自動(dòng)化、適用于多指標(biāo)檢測(cè)等優(yōu)點(diǎn),但也會(huì)受到在同一溫度下雜交,不同探針雜交效率不同等因素的制約。

  二、基因芯片

  基因芯片利用大規(guī)模集成電路的手段控制固相合成的成千上萬(wàn)個(gè)寡核昔酸探針,并把它們密集、規(guī)律地排列在1cm見(jiàn)方大小的硅片或玻璃晶片上,其容量可達(dá)20—40萬(wàn)個(gè)基因探針。然后將熒光標(biāo)記的DNA或cDNA樣品在芯片上與探針雜交,經(jīng)激光共聚焦顯微鏡掃描,以計(jì)算機(jī)系統(tǒng)對(duì)熒光信號(hào)作出比較和檢測(cè)??蒲猩?,主要應(yīng)用于發(fā)現(xiàn)新的功能基因,基因表達(dá)分析﹑DNA序列測(cè)定和比較﹑突變體和多態(tài)性的檢測(cè)等方面。

  在臨床上,基因芯片技術(shù)已經(jīng)成熟應(yīng)用于產(chǎn)前染色體微陣列分析(CMA),胚胎植入前染色體異常(PGS)等方面,罕見(jiàn)遺傳病診斷,耳聾基因突變位點(diǎn)檢測(cè),呼吸道病原體檢測(cè)與分型等多個(gè)方面。

  現(xiàn)在全世界已有十多家公司專門(mén)從事基因芯片的研究和開(kāi)發(fā)工作,且已有較為成型的產(chǎn)品和設(shè)備問(wèn)世?;蛐酒氖袌?chǎng)由于較高的技術(shù)門(mén)檻、研發(fā)投入要求高、昂貴的使用成本等原因,整體呈現(xiàn)寡頭壟斷的格局。

  2007年,Roche以2.725億美元收購(gòu)了NimbleGen公司,總銷售額位居第四。NimbleGen成立于1999年,主要研發(fā)基因組分析所用的高密度芯片,這家位于麥迪遜的生物技術(shù)公司,在全球芯片市場(chǎng)上排名第4。但是Roche于2018年宣布,它將在未來(lái)兩年內(nèi)關(guān)閉位于麥迪遜的測(cè)序方案工廠(前身為NimbleGen)。這可能與其2012年宣布退出固相DNA芯片市場(chǎng),專注于測(cè)序以及測(cè)序上游的序列捕獲技術(shù)的市場(chǎng)戰(zhàn)略相關(guān)。

  1999年成立的Illumina業(yè)務(wù)起家主要是銷售微陣列芯片(microarray chip),這種芯片可用來(lái)檢測(cè)基因組上特定部位的重要變化。2007年,Illumina宣布以6億美元收購(gòu)基因測(cè)序公司Solexa,從而進(jìn)軍基因測(cè)序市場(chǎng),開(kāi)始實(shí)現(xiàn)差異化的跨越式發(fā)展。主營(yíng)方向改為基因測(cè)序,其2013﹑2014﹑2015的基因芯片業(yè)務(wù)占比持續(xù)下滑,分別為27%﹑19%和14%,營(yíng)業(yè)額分別為3.8億美元﹑3.5億美元和3.1億美元。

  美國(guó) Affymetrix 公司目前是基因芯片行業(yè)的領(lǐng)頭羊(2016年被賽默飛以13億美元收購(gòu)),1992-Stephen P.A. Fodor博士在硅谷成立Affymetrix公司,1994-商業(yè)化運(yùn)營(yíng)GeneChip,推出了第一張商業(yè)化基因芯片,并且注冊(cè)了商標(biāo)。Affymetrix的專利是光引導(dǎo)原位寡聚核苷酸合成技術(shù)。年產(chǎn)寡聚核苷酸基因芯片達(dá)幾十萬(wàn)張,占據(jù)表達(dá)譜基因科研市場(chǎng)的一半以上。

  PerkinElmer于2010年斥資9000萬(wàn)美元收購(gòu)芯片制造商Signature Genomics。Signature Genomics是一家率先采用染色體微陣列技術(shù)做產(chǎn)前和產(chǎn)后細(xì)胞遺傳學(xué)檢測(cè)的公司。目前核心產(chǎn)品CGX Oligo整合了芯片雜交系統(tǒng)、芯片掃描儀ScanRI及數(shù)據(jù)可視化軟件Genoglyphix®等,組成了染色體微整列分析完整的生態(tài)系統(tǒng)。另外值得一提的是,PE旗下的Packard公司開(kāi)發(fā)出第一臺(tái)商業(yè)化芯片Scan Array 3000,并擁有多項(xiàng)技術(shù)專利,使得PE成為芯片掃描儀市場(chǎng)的領(lǐng)導(dǎo)者,全球市場(chǎng)份額躍居第一。

  安捷倫是生命科學(xué)、診斷和應(yīng)用化學(xué)市場(chǎng)領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者。安捷倫擁有專利的基因芯片的制造工藝—噴墨打印化學(xué)原位合成技術(shù)。產(chǎn)品包括:全基因組表達(dá)譜芯片、小RNA芯片、Human CGH+SNP 芯片、基因芯片微陣列掃描儀等。2015年1月27日,Agilent宣布,NMPA已批準(zhǔn)公司的SureScan Dx微陣列芯片掃描儀作為體外診斷的醫(yī)療器械應(yīng)用。專家認(rèn)為把微陣列掃描技術(shù)帶入到臨床質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)是將全基因組染色體分析的優(yōu)勢(shì)推廣到臨床領(lǐng)域的一個(gè)重要里程碑。

  三、蛋白質(zhì)芯片和微流控芯片

  蛋白質(zhì)芯片又稱蛋白質(zhì)微陣列,可用于蛋白質(zhì)功能研究與相互作用分析。蛋白質(zhì)芯片采用原位合成,機(jī)械點(diǎn)樣或共價(jià)結(jié)合的方式將酶、抗原、抗體、受體、配體、細(xì)胞因子等固定于玻片、硅、云母及各種膜片形成的生物分子集陣。

  不得不提的液相芯片技術(shù)是20世紀(jì)90年代后期發(fā)展起來(lái)的被喻為后基因組時(shí)代的芯片技術(shù),由美國(guó)納斯達(dá)克上市公司Luminex研制開(kāi)發(fā),國(guó)際上又被稱為XMAP(flexible Multilyte Profiling)技術(shù)。核心專利是乳膠微球包被﹑熒光編碼以及微球分子雜交。其反應(yīng)快速,靈敏度極高,微球上固定的探針與待測(cè)樣品在溶液中反應(yīng),碰撞速率是固相芯片或Elisa的10倍以上,并且采用96孔板為反應(yīng)容器,通量大。

  到2005年全球獲得FDA認(rèn)證的液相芯片項(xiàng)目已近200個(gè)。其全球最達(dá)的檢測(cè)平臺(tái)為美國(guó)Luminex公司和荷蘭的QIAGEN跨國(guó)公司。而在美國(guó)Luminex公司生產(chǎn)的Luminex檢測(cè)系統(tǒng)上,目前已有國(guó)內(nèi)生產(chǎn)的商品化試劑供應(yīng):比如上海透景公司生產(chǎn)的腫瘤標(biāo)志物18項(xiàng)檢測(cè)產(chǎn)品、HPV檢測(cè)產(chǎn)品和Torch檢測(cè)產(chǎn)品等。另外研發(fā)可根據(jù)研究需要自行制備探針微球交聯(lián)微球,建立反應(yīng)體系對(duì)各種標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),如細(xì)胞因子IL-2、IFN-r、IL-4水平檢測(cè)和抗核抗體檢測(cè)等。

  微流控芯片實(shí)驗(yàn)室技術(shù)的核心在于精確控制在微升和納升級(jí)反應(yīng)空間中流動(dòng)的液體,來(lái)完成一系列的反應(yīng),分離和檢測(cè)。目前一些商業(yè)公司如Agilent﹑Caliper為微流控分析儀開(kāi)發(fā)了系列試劑盒,目前只針對(duì)毛細(xì)管電泳功能,還未達(dá)到真正的集成化。1999年惠普(現(xiàn)Agilent)與Caliper合作,首臺(tái)微流控芯片商品化儀器Bioanalyzer 2100開(kāi)始在歐美市場(chǎng)銷售,累計(jì)銷售超萬(wàn)臺(tái)。Caliper的旗艦產(chǎn)品為L(zhǎng)abChip 3000新藥研發(fā)系統(tǒng),主要應(yīng)用是高通量藥物篩選。據(jù)Caliper稱,其占據(jù)了75%的全球市場(chǎng)份額。

  國(guó)內(nèi)在微流控研發(fā)方面,涉及到很多的公司,包括博奧生物的呼吸道感染病原體微流控芯片、博暉創(chuàng)新的HPV基因分型檢測(cè)微流控芯片,萬(wàn)孚生物參股英國(guó)的Atlas Genetics。小型化的微流控儀器有理邦儀器的M16磁敏免疫分析儀,華邁興微的M2微型化學(xué)發(fā)光分析儀。其中,博奧生物的呼吸道病原體檢測(cè)系統(tǒng)已取得不俗佳績(jī),在全國(guó)31個(gè)省區(qū)市的200多家醫(yī)院投入使用,有些醫(yī)院的月檢測(cè)量已達(dá)600多份。博暉創(chuàng)新的24種基因型HPV病毒于2016年6月得到NMPA注冊(cè)證。

  結(jié)語(yǔ):

  總體而言,在研究方面,我國(guó)生物芯片的綜合學(xué)術(shù)水平與國(guó)際水平差距正在逐漸縮小,但在芯片各關(guān)鍵技術(shù)如輸運(yùn)和標(biāo)記整合技術(shù)、新型生物芯片設(shè)計(jì)理論體系、集成化檢測(cè)技術(shù)等方面的基礎(chǔ)研究水平仍有待提高。在產(chǎn)業(yè)化方面,我國(guó)生物芯片的產(chǎn)業(yè)發(fā)展在面臨著巨大挑戰(zhàn)的同時(shí),正面臨著良好的機(jī)遇。生物芯片技術(shù)正逐步走向整體化、系統(tǒng)化,相應(yīng)的配套試劑、儀器和軟件的研究越來(lái)越受到重視。我們期待我國(guó)生物芯片技術(shù)將在不遠(yuǎn)的將來(lái)與世界同行同臺(tái)競(jìng)爭(zhēng),為國(guó)民生活質(zhì)量的提高,為人類的科技的發(fā)展做出應(yīng)有的貢獻(xiàn)。

來(lái)源:思宇醫(yī)械觀察

 
 
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